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Biotempo 2014, Volumen 13, 9-13
RESUMEN
proceso
de
de individuos de género masculino en
diversos
casos forenses.
Actualmente
es una
herramienta
marcadores, aportara una base de datos peruana y comparar con parientes de la línea masculina.
Distribución de frecuencias alélicas y haplotípicas para los 03 marcadores analizados: se determinaron 77
haplotipos con 03 marcadores STR, y en la población de Lima Perú, realizada durante los años 2010-2012.
Palabras clave: Tipicación ADN, Cromosoma Y, Diversidad haplotipica, STR Y.
SUMMARY
and statistical analyses are performed
to improve data bases
for
comparison
with
relatives of the male line.
Distributions of allele and haplotype frequencies for the 05 markers were
analyzed: 77 haplotypes were
Lima-Perú Population during 2010-2012.
Keywords: Typing DNA, Y chromosome, haplotipo, diversity, STR Y
DIVERSIDAD hAPLOTIPICA DE CINCO STR DEL CROMOSOMA Y EN
LA POBLACIóN DE LIMA-PERú
Jorge Hau Camoretti 1, 2
Cynthia Leon Mendoza, 2
1 Laboratorio de Biología Molecular ADN Forense, Dirección de Criminalística de la Policía Nacional del Perú.
2 Laboratorio de Bioquímica y Genética Molecular, Facultad de Ciencias Biológicas Universidad Ricardo Palma.
INTRODUCCIóN
En Criminalística una ciencia que ha desarrollado
enormemente es la Biología Molecular con el es-
tudio del Acido Desoxirribonucleicos (ADN). Los
análisis de ADN se han transformado en una de las
pruebas más importante en la investigación Crimi-
nal y en los casos de paternidad discutida.
En el Perú ha aumentado los casos de violaciones
sexuales y la prueba de ADN es muy importan-
te para determinar a quién le pertenece el semen
encontrado en la victima y en la escena del delito,
para ello es necesario tener la frecuencia poblacio-
establecer la probabilidad de coincidencia entre la
muestras analizadas con estadística poblacional pe-
ruana.
-
10
Biotempo 2014, Volumen 13, 9-13
individuos), resultante de variaciones en la secuen-
determinadas por el número de veces que se presen-
ta un alelo con respecto al número total de alelos en
una población para un locus en particular (frecuen-
-
en forma ligada de generación en generación en
individuos de sexo masculino como un haplotipo
(combinación de estados alélicas de secuencias po-
-
no), y traza la evolución del linaje paternal, además
1,2
-
ran los perfiles genéticos de casos de violaciones
y restos esqueléticos exhumados en varias pobla-
-
dos de muestras de referencia de familiares de las
-
das con marcadores STR autosómicos de rutina
(AmpFiSTR® Identifiler™de Applied Biosystems
-
res STR autosómicos utilizados para muestras en
mal estado de conservación o con presencia de in
Para estos casos, las muestras de referencia de fa-
miliares en primer grado de consanguinidad (hijos
y progenitores) son las más indicadas para dar una
probabilidad informativa mayor a 99.9%. Sin em-
bargo, no siempre se cuenta con familiares ascen-
dientes y descendientes directos de los desapareci-
dos sino que esta comparación se hace con otros
familiares, quienes pueden ser hermanos paternos,
abuelos paternos u otros parientes, evaluándose un
vínculo de parentesco patrilineal donde se obtiene
-
-
complementar el índice de parentesco y probabili-
dad que en algunos casos, es menor a 99.9%. Tam-
bién es una herramienta útil en desastres masivos
en los que no se pueden individualizar los restos
mortales, ni determinar la cuarteta básica (sexo,
edad, estatura y raza) como tamizaje y correlación
con los grupos familiares para seguir con el proceso
de identificación. Igualmente, en paternidad civil de
hijos varones, con ausencia del padre biológico, el
haplotipo debe coincidir con el haplotipo de parien-
tes masculinos del presunto padre, determinando se
el linaje paterno del grupo familiar. Adicionalmente
es útil en los delitos contra la libertad sexual de los
de ADN de individuos de género masculino, o bien
3, 4, 5.
En estos estudios es fundamental el conocimiento
previo de las frecuencias génicas y haplotípicas de
de Lima puesto que tiene un alto grado de mestiza-
je y aquí están presentes persona de los diferentes
partes del Perú, para fortalecer la base de datos de
referencia nacional que permita la asignación de
-
mana
.
Por esta razón se presentan en este estudio los ha-
plotipos y estimaciones de las frecuencias poblacio-
nales resultado del análisis de 03 marcadores STRs
paterna para ser utilizado en una gran base de da-
tos de referencia nacional que recopile frecuencias
génicas y haplotípicas de los análisis poblacionales
estudiados por el Laboratorio de Biología Molecu-
lar ADN Forense de la Dirección de Criminalísti-
ca de la Policía Nacional del Perú.
Los resultados a obtenerse nos permitirán la intro-
al Banco de Datos de ADN de la Policía Nacional
del Perú, con los que se podrán conocer cual o cua-
les de los marcadores moleculares son más y menos
-
nar la frecuencia haplotipica cada marcador mole-
cular, la diversidad haplotípica y la capacidad de
discriminación.
En la base de datos Y-STR Haplotype Referente Data-
base, que se puede encontrar en http://ystr.charite.de/
index_gr.html, hay casi 10.000 haplotipos de 72 po-
blaciones distintas, y se actualiza de forma continua.
Por otro lado, existe una base de datos similar para
http://
ystr.org/usa/, con casi 2,000 haplotipos provenientes
de 30 poblaciones distintas.
Una de las grandes contribuciones del presente tra-
-
ción de justicia, donde las frecuencias haplotípicas
de los marcadores moleculares del cromosoma Y,
hallados serán empleados en los cálculos estadísti-
cos de los dictámenes periciales de determinación
de linaje paterno y en casos de asaltos sexuales. Al
utilizar frecuencias propias de la población peruana
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en los cálculos estadísticos harán que se obtengan
resultados sean más precisos, dejándose de lado las
frecuencias de hispanos americanos o de países ve-
cinos.
MATERIAL Y MÉTODOS
a. Muestras biológicas: se recolectaron 250 mues-
tras de individuos varones no emparentados de 05
zonas que se dividió Lima: Centro, Sur, Norte, Este,
punción del dedo y se impregnaron a las tarjetas de
FTA para sangre, se rotularan y dejaran secar a tem-
peratura ambiente12.
b. Sujetos de Experiencia: Se tomarán 250 mues-
tras de individuos varones no emparentados, los que
fueron agrupados en cinco grupos correspondientes
a las zonas: este, oeste, norte, sur y centro de la ciu-
dad de Lima, tomándoseles a cada uno como mues-
tra biológica: sangre.
Los donantes o sujetos de experiencia fueron infor-
mados del estudio ha realizarse, para lo cual se ela-
boró chas de consentimiento, en el que se plasmó
la investigación ha realizarse, los propósitos de la
investigación, datos de las personas, sus familiares,
-
madas en señal de su respectivo consentimiento
c. Métodos a Utilizar: Una vez tomadas las mues-
tras se secaron y guardaron a temperatura ambiente
hasta su análisis en el laboratorio, donde se realizó-
las siguientes etapas:
Extracción de ADN: Extracción de ADN de sangre
(Método: FTA)12.
Amplicación del ADN.
-
mega
de 25 µl con los siguientes componentes: Gold STR
mix 2.5 ul, Amplitaq Gold DNA polymerase 0.55
ul, ADN de 1 nr 19.42 ul. La reacción en cadena de
la polimerasa (PCR) se llevó a cabo en un Termoci-
clador GeneAmp®PCR System 97009, 10, 11.
Tipicación de los polimorsmos del ADN. Se
utilizó un Analizador Genético ABI PRISM®310
(Applied-Biosystems, Foster City, CA)9
-
ción molecular y se siguieron las instrucciones de la
casa comercial. El software Genotyper®, analiza el
estándar de tamaño de control interno Internal Lane
para asegurarla precisión en cada inyección del ca-
pilar. La asignación alélica se realizó por compara-
ción de los fragmentos obtenidos en pares de bases
para cada pico del alelo de las muestras analizadas
y se tuvieron en cuenta las recomendaciones del
grupo de referencia de la Sociedad Internacional de
Genética Forense (ISFG)
13,10
.
Análisis estadísticos: La estimación de las frecuen-
-
porción en la que se encuentra cada alelo o haploti-
po dentro de la población de estudio y la frecuen-
cia de los haplotipos. La diversidad alélica (génica)
de los marcadores moleculares usados con respecto
a la sumatoria de las frecuencias de cada polimor-
usó el software Arlequín versión 3.1. La capaci-
dad discriminatoria se determinó con el número de
haplotipos observados sobre el total de individuos
analizados y la probabilidad de coincidencia al azar
se estimó para determinarla probabilidad quedos
individuos seleccionados al azar en la población
RESULTADOS
En la tabla N° 01 se observa lo siguiente:
▪
▪
En la tabla N° 02 se observa lo siguiente:
▪Se obtuvo 77 haplotipos diferente entre las 250
muestras analizadas,
▪Las frecuencias de los haplotipos se observa don-
de se encuentra más de 01 haplotipo, se ha visto
que corresponde a una misma de ciudad de origen,
como es el caso de haplotipo 31, se nos demuestra
que en la ciudad de Lima Perú hay una conjunción
de los todas las ciudades del Perú
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Tabla 1: Distribución de la frecuencia alélica, nú-
mero de alelos y diversidad génica de los 03 SRT
7
8
9
10 0.115 0.034
11 0.494 0.241
12 0.379 0.540
13 0.011 0.011
14 0.011
15 0.011
NA 4 4
GD 0.4830
NA : Numero de alelos
GD: Diversidad Génica
Tabla 2: Distribución de la frecuencia
haplotípica de los 03 SRT del cromosoma
y de la población de Lima.
N°
H1 14 12 12 5
H2 15 12 12 7
H3 14 11 12 5
H4 14 12 13 10
H5 14 11 12 1
15 12 12 1
H7 15 12 13 5
H8 14 11 11 1
H9 15 11 12 1
H10 14 12 12 5
H11 14 11 12 7
H12 14 12 12
H13 14 12 12 9
H14 14 12 11 5
H15 14 11 12 11
14 11 11 2
H17 14 12 11 11
H18 15 12 12 1
H19 10 12 4
H20 15 12 11 1
H21 14 11 12 1
H22 14 11 10
H23 14 11 13 1
H24 14 10 13 5
H25 14 12 12 1
15 10 12 5
H 27 14 11 13 1
H 28 14 11 12 1
H 29 14 11 13 4
H 30 14 11 12 1
H 31 14 11 13 15
H 32 14 11 10 1
H 33 15 12 11 1
H 33 14 12 11 1
H 34 14 10 11 5
H 35 14 11 12 1
14 11 13 1
H 37 14 11 12 11
H 38 15 12 11 5
H 39 14 10 10 1
H 40 11 12 1
H 41 14 11 11 1
H 42 15 12 12 5
H 43 15 11 12 1
H 44 14 10 11 1
H 45 14 12 12 1
14 11 11 2
H 47 15 12 12 5
N°
H 48 15 12 11 1
H 49 10 11 1
H 50 14 11 11 1
H 51 15 12 12 1
H 52 14 11 13 1
H 53 14 11 12 1
H 54 14 11 13 1
H 55 14 12 12 11
14 11 12 1
H 57 15 12 12 1
H 58 14 12 12 1
H 59 14 11 13 1
14 11 11 1
14 12 11 1
13 10 12 1
14 11 11 1
14 11 11 1
14 11 12 1
14 11 11 1
14 11 13 1
15 12 13 1
14 10 1
H 70 15 12 11 1
H 71 15 12 12 1
H 72 14 13 12 1
H 73 15 11 13 1
H 74 12 12 1
H 75 15 10 12 11
14 12 14 1
H 77 15 11 12 1
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