ARTICULO ORIGINAL
REVISTA DE LA FACULTAD DE MEDICINA HUMANA 2021 - Universidad Ricardo Palma
1 Universidad Católica Santo Toribio de Mogrovejo, chiclayo-Perú.
2 Hospital Regional Lambayeque, Lambayeque-Perú.
3 BioforLatam.
a Médico Neumólogo Pediatra, Hospital Nacional Almanzor Aguinaga Asenjo.
b Mg. Física Aplicada.
RESUMEN
Objetivo: Determinar asociación entre la presencia de los polimorfismos V4 del gen ADAM33 y la enfermedad del asma y describir la frecuencia del polimorfismo T1 en pacientes de un hospital de la región Lambayeque. Materiales y métodos: Diseño de casos y controles. Escenario: Hospital Almanzor Aguinaga Asenjo – EsSalud, nivel de complejidad III-1. Población: pacientes entre 5-17 años atendidos por consultorio externo. Los casos fueron los pacientes diagnosticados según las directrices de Global Initiative for Asthma (GINA) 2016. Los controles fueron pacientes sin diagnóstico de alguna enfermedad pulmonar crónica ni antecedentes familiares de asma. Resultados: En su mayoría tanto casos como controles no presentaron el polimorfismo V4, siendo positivo solo en el 46% de los casos y 31% de los controles. Cuando se evaluó la asociación entre el polimorfismo V4 y la presencia de asma, el OR fue de 1,93 (IC95%: 0,62 – 6,00), con un valor no significativo (p = 0,196) para la prueba de Xi-cuadrado de Pearson. Sin embargo, el polimorfismo T1 estuvo presente en el 87% de casos; y la proporción de tumbesinos con la mutación fue mucho más baja que la de otras regiones. Conclusiones: No se encontró asociación entre el polimorfimo V4 y la presencia de asma en pacientes de un hospital de Lambayeque. El polimorfismo T1 se presenta con elevada frecuencia (87%) en los pacientes asmáticos del hospital Hospital Almanzor Aguinaga Asenjo – ESSalud.
Palabras claves: asma, polimorfismo genético y gen ADAM33 (Fuente: DeCs-BIREME)
ABSTRACT
Objective: To determine the association between the presence of V4 polymorphisms of the ADAM33 gene and asthma disease and to describe the frequency of T1 polymorphism in patients from a hospital in the Lambayeque region. Materials and methods: Design of cases and controls. Location: Hospital Almanzor Aguinaga Asenjo - EsSalud, level of complexity III-1. Population: patients between 5-17 years old attended by an outpatient clinic. The cases were patients diagnosed according to the Global Initiative for Asthma (GINA) 2016 guidelines. Controls were patients without a diagnosis of any chronic lung disease or a family history of asthma. Results: In most cases, both cases and controls did not present the V4 polymorphism, I feel positive only in 46% of cases and 31% of controls. When the association between the V4 polymorphism and the presence of asthma was evaluated, the OR was 1.93 (95% CI: 0.62 - 6.00), with a non-significant value (p = 0.196) for the Xi test --Pearson square. However, the T1 polymorphism was present in 87% of cases; and the proportion of Tumbesinos with the mutation was much lower than that of other regions. Conclusions: No association was found between the V4 polymorphism and the presence of asthma in patients from a Lambayeque hospital. The T1 polymorphism occurs quite frequently in asthmatic patients at Hospital Almanzor Aguinaga Asenjo - ESSalud.
Key words: Asthma, SNPs, ADAM proteins (Source: MeSH)
Población y muestra
Se elaboró un estudio con diseño de casos y controles para el polimorfismo V4, y uno transversal descriptivo para el T1. Se compararon dos grupos en el rango de edad entre 5-17 años atendidos por consultorio externo del Hospital Almanzor Aguinaga Asenjo-ESSalud (Hospital lll-1) del departamento de Lambayeque, durante el año 2019: los casos fueron pacientes diagnosticados según las directrices de Global Initiative for Asthma (GINA) 2016 y aquellos con ausencia de síntomas debido a utilización de medicamentos antiasmáticos, así mismo, se excluyeron pacientes con crisis asmáticas; los sujetos de control no presentaron diagnóstico de alguna enfermedad pulmonar crónica ni antecedentes familiares de asma. En ambos grupos, se excluyeron aquellas muestras de hisopado bucal que dejaron de ser viables.
Se realizó un muestreo aleatorio simple para la obtención de los casos y los controles (V4), y un estudio censal para T1. Para estimar el tamaño de la muestra, se calculó 23 casos y 23 controles para el polimorfismo V4, teniendo 6.375 como OR esperado(25); y para el polimorfismo T1, la muestra estuvo constituida por todos los que pacientes asmáticos que aceptaron participar Se calculó con el software OpenEpi, utilizando un nivel de confianza del 95%, una potencia del 80%, una razón de controles por caso de 1. Todos los participantes firmaron un consentimiento y asentimiento informado, y el estudio se ajustó a los principios éticos de la investigación en seres humanos consignados en la Declaración de Helsinki y la Resolución 8430 de 1993 del Ministerio de Salud de Perú. Además, el estudio contó con la aprobación del Comité de Bioética de la facultad de medicina de la Universidad Católica Santo Toribio de Mogrovejo con N° de resolución N°593-2018-USAT-FMED y el Comité de Ética Hospital Almanzor Aguinaga Asenjo.
Toma de muestra y parámetros clínicos
Una vez finalizada la consulta se realizó el hisopado bucal en el mismo consultorio, a través de la invitación realizada por un médico neumólogo pediatra. La muestra de células bucales se obtuvo a partir del hisopado bucal con un hisopo estéril, que luego fue guardado en un tubo tapa rosca estéril de 15mL conteniendo 2mL de suero fisiológico. Las muestras se transportaron en un cooler con cadena de frío al Laboratorio de Investigación de la Universidad Católica Santo Toribio de Mogrovejo, en donde se refrigeraron hasta su procesamiento.
A través de una ficha de recolección de datos se obtuvieron datos generales de los pacientes como su edad, sexo, procedencia, duración de la enfermedad, y el control del asma que se obtuvo aplicando una encuesta recomendada por el GINA que constaba de cuatro preguntas. El tiempo promedio de la toma de muestra y del llenado del cuestionario fue de 10 minutos.
Extracción del ADN genómico y genotipificación
El ADN genómico se obtuvo usando el Kit de extracción PROMEGA, siguiendo las instrucciones recomendadas por el fabricante. Los polimorfismos T1 (rs2280091) y V4 (rs2787094) del gen ADAM33 se determinaron mediante PCR. La mezcla de amplificación para un volumen final de reacción de 20 μl contenía 20 ng de ADN genómico y una concentración final de 2.5 uM de cloruro de magnesio, 200 uM de DNTPs y 1 uM de cada cebador. Se empleó el termociclador (Biorad, EEUU) bajo las siguientes condiciones de temperatura: denaturación inicial a 95°C por 5 minutos, ciclos de 95°C por 30 segundos, hibridación a 65° por 30 segundos y extensión a 72° por 30 segundos, una extensión final de 72° por 5 minutos se efectuó para posteriormente almacenar los productos de amplificación a 4°C hasta su electroforesis (Tabla 1). La electroforesis se realizó en poliacrilamida al 2%.
Técnica RFLP
Los productos de amplificación de los genes T1 con 374bp y V4 de 400bp fueron cortados con las enzimas Ncol y Pst1 respectivamente el tiempo de incubación fue de 37° por 15 horas para las dos enzimas en un volumen final de 37 ul. Los productos de restricción se observaron en gel de poliacrilamida al 2% y visualizados con transiluminador UV.
Tabla 1. . Primers y programas de PCR para genotipificar ADAM3 por PCR-RFLP
SNP ID |
Gen/SNP primer |
Secuencia |
Programa de PCR |
---|---|---|---|
Rs2787094 |
ADAM33 V4C/G F ADAM33 V4C/G R |
5’-ACACACAGAATGGGGGAGAG-3’ 5’-CCAGAAGCAAAGGTCACACA-3’ |
94°C 5 min; 35 ciclos, 94°C 30s, 53°C 30 s, 72°C 30 s; 72°C 5 min |
Rs2280091 |
ADAM33 T1A/G F ADAM33 T1A/G R |
5’-ACTCAAGGTGACTGGGTGCT-3’ 5’-GAGGGCATGAGGCTCACTTG-3’ |
94°C 5min; 35 ciclos, 94°C 30s, 54°C 30s, 72°C 30 s; 72°C 5 min |
Tabla 2. Enzimas de restricción y longitud de los fragmentos digeridos
V4C/G | T1A/G | |
---|---|---|
Enzima de restricción |
Pstl G: 168+206 C: 374 |
Ncol A:140+260 G:400 |
Análisis estadístico
Se calcularon medidas de tendencia central, especialmente medianas, y de dispersión para describir las variables cuantitativas. Las variables cualitativas se expresaron con frecuencias absolutas y relativas.
Para determinar la asociación entre el polimorfismo V4 y la presencia de asma, se empleó la aprueba de Xi-cuadrado de Pearson, y posteriormente se calculó el OR. El polimorfismo T1 se describió con frecuencias absolutas y relativas. Para todas las pruebas se empleó un nivel de confianza del 95%, y un nivel de significancia del 5% o 0,05. Para todos los análisis estadísticos se empleó el software SPSS versión 25.0 (IBM, Nueva York).
RESULTADOS
Tabla 3. Características demográficas y clínicas de casos y controles
Variable | Casos V4 n (%) |
Controles V4 n (%) |
valor-p | Casos& (T1) |
---|---|---|---|---|
Sexo |
||||
Masculino Femenino |
17 (65) 9 |
13 (50) 13 (50) |
|
15 (40) 23 (60 |
Edad (Med; RI) Procedencia |
8; 5-10,3
|
9; 7-11,3
|
|
9,5; 7-11,3
|
Lambayeque Tumbes Cajamarca Otros |
18 (70) 4 (15) 2 (7,5) 2 (7,5) |
21 (81) 2 (7,5) 1 (4) 2 (7,5) |
|
20 (53) 12 (32) 2 (5) 4 (10) |
Tiempo de enfermedad (Med; RI) Tiempo enfermedad categorizado |
3; 2 – 6,3
|
-
|
-
|
3; 1 – 5,3
|
1 – 5 años > 5 años < 1 año |
17 (65) 7 (27) 2 (8) |
-
- |
- |
26 (69) 9 (24) 3 (7) |
Control del asma | ||||
Parcialmente controlado Bien controlado No controlado |
14 (54) 8 (31) 4 (15) |
-
|
-
|
17 (45) 16 (42) 5 (13) |
V4 | ||||
Negativo Positivo |
14 (54%) 12 (46%) |
18 (69%) 8 (31%) |
|
-
|
T1 | ||||
Negativo Positivo |
-
|
-
|
|
5 (13) 33 (87) |
Con respecto a las variables sociodemográficas la mediana de edad global fue de 9 años (RIC: 6 – 11 años), los casos V4 tuvieron una mediana de edad de 8 (RIC: 5 - 10,3) y los controles V4 tuvieron una mediana de edad de 9 años (RIC: 7 – 11,3). La proporción de casos hombres fue de 65% y 40% para V4 y T1, respectivamente; mientras que en los controles la proporción de hombres y mujeres fue similar (50%).
El 54% de pacientes que presentaban el polimorfismo V4 tenían el asma parcialmente controlado, mientras que los pacientes que presentaban el polimorfismo T1, el 45% estaba parcialmente controlado y el 16% bien controlado. En ambos grupos solo el 15 y 13% no estaban controlados.
La mediana para el tiempo de enfermedad tanto para los casos con el polimorfismo V4 y T1 fue de 3 años (RI: 2 – 6,3 y RI: 1 – 5,3 años), respectivamente; así mismo, más de la mitad en ambos grupos (65 y 69% para V4 y T1) presentaron un tiempo de enfermedad que oscilaba entre 1 a 5 años.
Con respecto a la procedencia, ambos grupos procedían en su mayoría de Lambayeque. Con respecto al polimorfismo V4, en su mayoría tanto casos como controles no presentaron el polimorfismo, siento positivo solo en el 46% de los casos y 31% de los controles. Sin embargo, el polimorfismo estuvo presente en el 87% de casos.
Cuando se evaluó la asociación entre el polimorfismo V4 y la presencia de asma, el OR fue de 1,93 (IC95%: 0,62 – 6,00), valor p = 0,196 par la prueba de Xi-cuadrado de Pearson.
Tabla 4. Frecuencia de polimorfismoV4 según el sexo
V4 | Femenino | Masculino | Total |
---|---|---|---|
Negativo |
13 |
19 |
32 |
Positivo |
9 |
11 |
20 |
Total |
22 |
30 |
52 |
No se encontraron diferencias respecto de la proporción de varones y mujeres con la presencia de la mutación. Respecto del total de mujeres, el 41% presentó el polimorfismo, mientras que del total de varones el 37% lo presentó.
Tabla 5. Frecuencia de polimorfismoV4 según el Control del asma
V4 | Bien Controlado | No Contralado | Parcialmente Controlado | Total |
---|---|---|---|---|
Negativo (C) |
6 |
2 |
6 |
32 |
Positivo (G) |
2 |
2 |
8 |
20 |
Total |
8 |
4 |
14 |
52 |
La razón de casos con presencia y ausencia del factor según el tiempo de enfermedad se mantiene cercano a 1:1. Considerando la clasificación según el tipo de control del asma, la proporción de secuencias con citosina y guanina para los pacientes catalogados como “no controlados” y “parcialmente controlados” se mantuvo en 1:1, excepto para el caso de los pacientes “bien controlados”, cuya proporción de pacientes con C a G fue de 3:1.
Tabla 6. Frecuencia de polimorfismoV4 según la procedencia
V4 | Amazonas | Cajamarca | Lambayeque | Trujillo | Tumbes | Total |
---|---|---|---|---|---|---|
Negativo |
0 |
2 |
23 |
1 |
6 |
32 |
Positivo |
1 |
1 |
16 |
1 |
1 |
20 |
Total |
1 |
3 |
39 |
2 |
7 |
52 |
La razón de factores positivos a negativos fue de aprox. 1:1, excepto para Tumbes, donde la proporción de tumbesinos con la mutación es mucho más baja que la de otras regiones. Respecto del total de pacientes procedentes de Tumbes, solamente 14% presentó la mutación, mientras que en Cajamarca fue del 33%, y Lambayeque del 41%.
DE T1
De los 37 pacientes con asma a quienes se les evaluó el polimorfismo T1, el 87% presentó el polimorfismo, y solamente 5 pacientes no lo presentaron, de ellos, 3 procedieron de Lambayeque, 3 presentaban asma bien controlado, 3 fueron varones, y 3 presentaron de uno a cinco años de enfermedad.
DISCUSIÓNCONCLUSIÓN
No se encontró asociación entre el polimorfimo V4 y la presencia de asma en pacientes de un hospital de Lambayeque. Los casos procedentes de tumbes presentan una proporción de mutación mucho menor a la de otras regiones, y el polimorfismo T1 se presenta con bastante frecuencia en los pacientes asmáticos del hospital Hospital Almanzor Aguinaga Asenjo – ESSalud.
Agradecimiento: Se agradece el financiamiento parcial por parte de la Universidad Santo Toribio de Mogrovejo.
Contribuciones de Autoría: Los autores participaron en la concepción y diseño del
trabajo, recolección, análisis e interpretación de la información, revisión crítica y redacción
de la versión final.
Financiamiento: El 40% del estudio fue autofinanciado, el otro 60% tuvo un
financiamiento
interno por parte de la Universidad Católica Santo Toribio de Mogrovejo.
Conflictos de intereses: No existió conflicto de interés.
Recibido: 13 de diciembre 2020
Aprobado: 07 de febrero 2021
Correspondencia: Alain Eduard Monsalve Mera.
Dirección: Av. Mariscal Nieto N°480, Chiclayo, Lambayeque-Perú.
Teléfono: (+51) 919060424
Correo: monsalvemera@gmail.com