Análisis de genomas de SARS-CoV-2 en muestras de Perú: Analysis of SARS-CoV-2 genomes samples from Peru

Johnny Leandro Saavedra Camacho; Sebastian Iglesias-Osores; Miguel Alcántara-Mimbela; Lizbeth M. Córdova-Rojas

doi:10.25176/RFMH.v21i3.3712

Autores/as

Johnny Leandro Saavedra Camacho https://orcid.org/0000-0002-3842-4314
Sebastian Iglesias-Osores https://orcid.org/0000-0002-4984-4656
Miguel Alcántara-Mimbela https://orcid.org/0000-0001-9189-9098
Lizbeth M. Córdova-Rojas https://orcid.org/0000-0002-9998-5019

DOI:

https://doi.org/10.25176/RFMH.v21i3.3712

Palabras clave:

Infecciones por Coronavirus, Genoma Viral, Secuenciación Completa del Genoma, Mutación, Perú

Resumen

Introducción: El análisis genómico de muestras de casos documentados de COVID-19 puede usarse con éxito para ayudar a rastrear fuentes de infección por Sars-Cov-2, que pueden ponerse en cuarentena para prevenir la propagación recurrente de la enfermedad en todo el mundo. Objetivo: Describir las secuencias de SARS-CoV-2 aisladas de pacientes peruanos. Métodos: Se seleccionaron todos los genomas publicados hasta marzo del 2021, subidos en el repositorio de GISAID y Nextstrain. Todos los datos están en la web de manera pública; además se filtró la información por continente, país, región, clado, linaje y sexo desde marzo de 2020 hasta febrero de 2021. Resultados: Se evidenció que la región con la mayoría de los genomas aislados fue Lima, el clado más frecuente es el GR, el linaje viral B.1.1 es el más frecuente y persistente en tiempo y la mayor parte de genomas fueron aislados de personas del sexo femenino. Conclusiones: El clado GR es común para todos los países sudamericanos y los continentes europeos y asiáticos, seguido de los clados G y GH con mayor frecuencia; por otro lado, el linaje viral más persistente en Perú es el B.1.1, siendo este dato no común con otros países.